Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms