Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms