Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms