Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI6

TFCP2L1, Transcription factor CP2-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2L1Q9NZI6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TFCP2L1Q9NZI6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFCP2L1Q9NZI6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms