Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC5A4Q9NY91 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A4Q9NY91 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms