Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJC28Q9NX36 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms