Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO28Q9NVF7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms