Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms