Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUK0

MBNL3, Muscleblind-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBNL3Q9NUK0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBNL3Q9NUK0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms