Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATG3Q9NT62 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms