Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms