Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms