Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DUOX1Q9NRD9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms