Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM10Q9NQV6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRDM10Q9NQV6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRDM10Q9NQV6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRDM10Q9NQV6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM10Q9NQV6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM10Q9NQV6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms