Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQI0

DDX4, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX4Q9NQI0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX4Q9NQI0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX4Q9NQI0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX4Q9NQI0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX4Q9NQI0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX4Q9NQI0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX4Q9NQI0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX4Q9NQI0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX4Q9NQI0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX4Q9NQI0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX4Q9NQI0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX4Q9NQI0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX4Q9NQI0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX4Q9NQI0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX4Q9NQI0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX4Q9NQI0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX4Q9NQI0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX4Q9NQI0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX4Q9NQI0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX4Q9NQI0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX4Q9NQI0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX4Q9NQI0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX4Q9NQI0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX4Q9NQI0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms