Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms