Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX8Q9HC52 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX8Q9HC52 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms