Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 MGST1-204ENST00000396209 979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 WWOX-AS1-201ENST00000567099 443 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF39Q9H2S5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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