Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC8Q9H0W5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms