Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MTMR12Q9C0I1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms