Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT23Q9C075 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms