Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP1Q9C000 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms