Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms