Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms