Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTRT3Q9BYD9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTRT3Q9BYD9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTRT3Q9BYD9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTRT3Q9BYD9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTRT3Q9BYD9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTRT3Q9BYD9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTRT3Q9BYD9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTRT3Q9BYD9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTRT3Q9BYD9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTRT3Q9BYD9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms