Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5DQ9BY66 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms