Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NDC1Q9BTX1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NDC1Q9BTX1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms