Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
RTKNQ9BST9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms