Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TINF2Q9BSI4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TINF2Q9BSI4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms