Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms