Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms