Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF2

STAC3, SH3 and cysteine-rich domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAC3Q96MF2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAC3Q96MF2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAC3Q96MF2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STAC3Q96MF2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STAC3Q96MF2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STAC3Q96MF2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
STAC3Q96MF2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STAC3Q96MF2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STAC3Q96MF2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
STAC3Q96MF2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
STAC3Q96MF2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
STAC3Q96MF2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms