Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms