Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKNOX2Q96KN3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms