Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZBED3Q96IU2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
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