Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTV1Q96GA3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms