Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RRP36Q96EU6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RRP36Q96EU6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RRP36Q96EU6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RRP36Q96EU6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RRP36Q96EU6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms