Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL53Q96EL3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL53Q96EL3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL53Q96EL3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL53Q96EL3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL53Q96EL3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL53Q96EL3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL53Q96EL3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL53Q96EL3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL53Q96EL3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL53Q96EL3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL53Q96EL3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL53Q96EL3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL53Q96EL3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL53Q96EL3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL53Q96EL3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL53Q96EL3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL53Q96EL3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL53Q96EL3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL53Q96EL3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL53Q96EL3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MRPL53Q96EL3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms