Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms