Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
FRAT1Q92837 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms