Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF3AQ92664 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms