Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPDL3BQ92485 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms