Protein–RNA interactions for Protein: Q92466

DDB2, DNA damage-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2Q92466 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DDB2Q92466 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDB2Q92466 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms