Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC107Q8WV48 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms