Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms