Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms