Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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