Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00301Q8NCQ3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00301Q8NCQ3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms