Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SPC24Q8NBT2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPC24Q8NBT2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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