Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00612Q8N6U2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms